Certaines espèces d'algues bleu-vert (cyanobactéries) produisent des toxines pouvant être dangereuses pour l'être humain. Ces fleurs d'eau peuvent être localisées ou étendues à l'ensemble d'un plan d'eau. Si une fleur d'eau d'algues bleu-vert est localisée à proximité d'une prise d'eau aménagée dans un lac ou d'un cours d'eau, sans système de traitement efficace, il est recommandé d'éviter d'utiliser cette eau pour boire, pour préparer des breuvages ainsi que pour préparer ou cuire les aliments. Faire bouillir l'eau n'est pas efficace pour éliminer les toxines. Cependant, il est possible d'utiliser cette eau pour l'hygiène personnelle, le lavage et autres usages domestiques sauf si elle présente une couleur ou une odeur inhabituelle. Si l'eau est manifestement colorée, il faut éviter les activités telles la baignade, le ski nautique, la planche à voile, la plongée ou le kayak. Il est possible de pratiquer à nouveau des activités aquatiques 24 heures après la disparition des fleurs d'eau des zones affectées.
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